Σε μία μεγάλη κατσαρόλα ζεσταίνουμε το ελαιόλαδο και σωτάρουμε τα κρεμμύδια για 2 με 3 λεπτά.
Προσθέτουμε τις μελιτζάνες, λίγο αλάτι και πιπέρι και μαγειρεύουμε μέχρι να μαλακώσουν.
Αποσύρουμε από τη φωτιά και αφήνουμε λίγο να κρυώσουν.
Σε μια μικρή κατσαρόλα βράζουμε το νερό και μαγειρεύουμε τον τραχανά και στη συνέχεια τον αφήνουμε λίγο να κρυώσει.
Προσθέτουμε τον τραχανά στις μελιτζάνες και στο μείγμα προσθέτουμε επίσης 150gr από το κεφαλοτύρι και τα χτυπημένα αβγά.
Αλείφουμε με ελαιόλαδο ένα ταψί 30Χ28 εκ. και στρώνουμε δύο φύλλα λαδώνοντάς τα. Μετά, διπλώνουμε ένα φύλλο στη μέση, το λαδώνουμε και το τοποθετούμε πάνω στα άλλα δύο.
Πασπαλίζουμε με 100gr από το κεφαλοτύρι, απλώνουμε πάνω του τη γέμιση και τέλος πασπαλίζουμε με το υπόλοιπο τυρί.
Στρώνουμε ένα λαδωμένο και διπλωμένο στη μέση φύλλο πάνω από τη γέμιση και μετά τα δύο τελευταία φύλλα λαδώνοντάς τα.
Γυρίζουμε προς τα μέσα τις άκρες των φύλλων που περισσεύουν χαράσσουμε σε κομμάτια και ψήνουμε σε προθερμασμένο φούρνο στους 180° για μιάμιση ώρα.
